Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms