Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms