Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BACE1P56817 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BACE1P56817 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BACE1P56817 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BACE1P56817 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms