Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNQ4P56696 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms