Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms