Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFDNP55196 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFDNP55196 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFDNP55196 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFDNP55196 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFDNP55196 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms