Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA2D1P54289 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms