Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCLMP48507 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLMP48507 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLMP48507 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLMP48507 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms