Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms