Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC19A1P41440 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC19A1P41440 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms