Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms