Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFNP31947 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFNP31947 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFNP31947 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFNP31947 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFNP31947 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFNP31947 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms