Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms