Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms