Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC27P30260 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms