Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms