Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms