Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA3P25788 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms