Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms