Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRP1P21291 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms