Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms