Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XBP1P17861 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XBP1P17861 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms