Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms