Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms