Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYL1P12980 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms