Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ODC1P11926 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODC1P11926 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms