Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms