Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms