Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms