Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYF2O95926 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms