Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POP4O95707 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POP4O95707 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POP4O95707 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POP4O95707 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms