Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECM2O94769 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM2O94769 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM2O94769 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM2O94769 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM2O94769 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM2O94769 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms