Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms