Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms