Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAK2O60296 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms