Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms