Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1AO15047 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms