Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3AO14802 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3AO14802 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms