Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms