Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRT4C9JH25 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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