Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms