Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRBOX1C9JBD0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms