Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms