Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYSRT1A8MQ03 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms