Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms