Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms