Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP3K4Q9Y6R4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms