Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms