Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHDC2Q9Y2U9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms