Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms